เว็บสล็อตการศึกษาข้อมูลขนาดใหญ่มาพร้อมกับความท้าทายในการจำลอง

ความจริงอาจหายากด้วยจุดข้อมูลนับล้านและมีพื้นที่สำหรับข้อผิดพลาดมากมาย

ในการสืบเสาะสำรวจเขตแดนที่ไม่รู้จักภายเว็บสล็อตในร่างกายของฉันเอง ฉันสะดุดกับปัญหาที่ยากที่สุดปัญหาหนึ่งที่วิทยาศาสตร์กำลังเผชิญอยู่

ประเด็นนี้เป็นผลที่ไม่อาจลอกเลียนแบบได้คือเมฆมืดที่ปกคลุมชีวิตและสังคมศาสตร์ การเผชิญหน้าของฉันเริ่มต้นขึ้นเมื่อฉันส่งตัวอย่างอุจจาระที่เหมือนกันไปยังบริการจัดลำดับไมโครไบโอมสองแห่ง ( SN Online: 6/17/14 ) ไมโครไบโอมเป็นชุมชนของจุลินทรีย์ที่อาศัยอยู่ในและบนร่างกายมนุษย์ และจากการศึกษาพบว่าไมโครไบโอมกำหนดรูปร่างสุขภาพและพฤติกรรม เป้าหมายของฉันคือการค้นหาแบคทีเรียที่อาศัยอยู่ในลำไส้ของฉัน ซึ่งเป็นส่วนที่มีจุลชีพมากที่สุดในร่างกาย

ฉันคิดว่ากระบวนการนี้จะตรงไปตรงมา: บริการทั้งสองอย่าง American Gut และ µBiome จะตรวจสอบ DNA จากจุลินทรีย์ในลำไส้ของฉันและบอกฉันว่ามีอะไรอยู่ในนั้น แต่เมื่อผลลัพธ์กลับมา ฉันไม่ฉลาดกว่าเมื่อก่อน — แค่สับสน โปรไฟล์ที่นำเสนอโดยบริการแสดงผลลัพธ์ที่แตกต่างกันอย่างมาก ตัวอย่างเช่น พวกเขารายงานการอ่านที่ตรงกันข้ามกันเกือบทั้งหมดในสัดส่วนของ Firmicutes และ Bacteroidetes ซึ่งเป็นไฟลาหลักสองชนิดที่พบในลำไส้ของมนุษย์ สิ่งนี้น่าผิดหวังเพราะการผสมผสานของทั้งสองสิ่งนี้อาจกำหนดว่ามีคนอ้วนหรือไม่และส่งผลต่อสุขภาพด้านอื่น ๆ ฉันคิดว่าอย่างน้อย ฉันจะได้เรียนรู้ว่าผู้เล่นหลักเหล่านี้อาศัยอยู่ในลำไส้ของฉันกี่คน ( SN: 1/11/14, หน้า 28 )

แม้ว่าแบคทีเรีย ไวรัส และเชื้อราที่นักวิทยาศาสตร์เกี่ยวกับไมโครไบโอมศึกษานั้นเป็นจุลทรรศน์ แต่ปริมาณข้อมูลที่จำเป็นในการจัดทำรายการจุลินทรีย์และหาผลกระทบต่อร่างกายก็มีมาก สำหรับตัวอย่างหนึ่งเช่นฉัน อาจมีแบคทีเรียหลายร้อยชนิด และ DNA อีกหลายพันบิตเพื่อจัดลำดับและวิเคราะห์ เพื่อบอกฉันว่าส่วนผสมส่วนตัวของฉันเป็นอย่างไร นักวิจัยได้เปรียบเทียบตัวอย่างของฉันกับคนอื่นๆ อีกหลายพันคน แต่หากต้องการค้นพบผลกระทบของจุลินทรีย์ต่างๆ ต่อสุขภาพ นักวิทยาศาสตร์อาจวิเคราะห์ตัวอย่างหลายร้อยหรือหลายพันตัวอย่าง โดยแต่ละตัวอย่างมีระบบนิเวศของจุลินทรีย์จำนวนมหาศาล ถ้าห้องปฏิบัติการสองแห่งไม่สามารถเก็บตัวอย่างของฉันได้อย่างถูกต้อง สิ่งนั้นบอกอะไรสำหรับการศึกษามากมายเกี่ยวกับแบคทีเรียที่เกี่ยวข้องกับสุขภาพและโรคของมนุษย์

เมื่อฉันทวีตและเขียนบล็อกเกี่ยวกับการค้นพบที่ผิดปกติ ผู้คนที่ศึกษาไมโครไบโอมสารภาพว่าพวกเขาไม่แปลกใจเลยที่ผลลัพธ์ของฉันจะแตกต่างออกไปอย่างสิ้นเชิง พวกเขาเคยประสบปัญหานี้มาก่อน และตอนนี้พวกเขากำลังเตรียมที่จะจัดการกับมัน ฉันได้รับเชิญให้ชม

นักวิจัยด้านไมโครไบโอมไม่ได้เป็นเพียงคนเดียวที่มีช่วงเวลาที่ยากลำบากในการจำลองผลลัพธ์ 

การเพิกถอนและการแก้ไขในวรรณคดีทางวิทยาศาสตร์กำลังเพิ่มขึ้น นักวิทยาศาสตร์กำลังโต้เถียงกันอย่างถึงพริกถึงขิงทั้งที่มาและวิธีแก้ปัญหาที่เป็นวิทยาศาสตร์แบบโยก ( SN: 1/24/15, p. 20 )

เป็นการยากพอที่จะทำซ้ำสิ่งที่ค้นพบจากการศึกษากับหนูหรือคนจำนวนหนึ่ง แต่ขยายงานให้ครอบคลุมจุดข้อมูลนับพันหรือล้านจุดที่รวบรวมจากหัวข้อการวิจัยจำนวนมาก เช่น ประเภทของงานที่ทำในด้านการขยายขอบเขตของจีโนม เป็นต้น และช่องว่างสำหรับข้อผิดพลาดก็เพิ่มขึ้นอย่างก้าวกระโดด

การวิจัยไมโครไบโอมเป็นเพียงหนึ่งในหลายๆ โครงการ “ข้อมูลขนาดใหญ่” ที่แพร่หลายในวิทยาศาสตร์เพื่อชีวิต สำหรับการศึกษาความเชื่อมโยงของจีโนมทั่วทั้งกลุ่ม นักวิจัยได้ติดตามตัวแปรดีเอ็นเอหลายแสนคนในคนหลายหมื่นคนเพื่อค้นหาการมีส่วนร่วมทางพันธุกรรมในโรคทั่วไป ในการจัดลำดับการศึกษา นักพันธุศาสตร์กำลังรวบรวมข้อมูล DNA หลายพันล้านบิตจากหัวข้อวิจัยนับแสนรายการตั้งแต่สัตว์ทดลองไปจนถึงมนุษย์ นักวิทยาศาสตร์ด้านสมองกำลังพยายามทำแผนที่เซลล์ประสาททั้งหมด 86 พันล้านเซลล์ในสมองของมนุษย์ และจัดทำรายการการเชื่อมต่อหลายล้านล้านที่พวกมันสร้างขึ้นกับเซลล์ประสาทอื่นๆ รายการดำเนินต่อไป

โครงการข้อมูลขนาดใหญ่ถูกกำหนดอย่างเป็นทางการว่าเป็นโครงการที่สร้างข้อมูลจำนวนมากที่คอมพิวเตอร์จำเป็นต้องจัดเรียงทั้งหมด แต่นั่นไม่ได้เริ่มจับขอบเขตของความพยายามเหล่านี้

Daniel MacArthur นักพันธุศาสตร์จาก Broad Institute of MIT และ Harvard ได้จัดตั้งกลุ่มพันธมิตรที่เรียกว่าExome Aggregation Consortiumร่วมกับนักวิทยาศาสตร์อีก 23 คนและผู้ร่วมวิจัยของพวกเขา กลุ่มนี้ได้รวบรวมข้อมูลทางพันธุกรรมจาก exomes หรือส่วนการเข้ารหัสโปรตีนของจีโนมของคนมากกว่า 90,000 คน ฐานข้อมูลมีข้อมูลดิบประมาณ 925 เทราไบต์ ซึ่งมากกว่าขนาดคอลเลกชันการพิมพ์ของหอสมุดรัฐสภาถึงเก้าเท่า และมีการเพิ่มจีโนมมากขึ้นตลอดเวลา นักวิจัยคนอื่นๆ จำนวนมากกำลังสร้างข้อมูลจำนวนมหาศาลของตนเอง

ข้อมูลที่ฝังอยู่ในนั้นคือเหมืองทองคำที่มีศักยภาพ ตัวอย่างเช่น การศึกษาล่าสุดเกี่ยวกับจีโนมของแบคทีเรีย 2,430 ตัว แสดงให้เห็นว่าจุลินทรีย์ที่เป็นมิตรสามารถสร้างโมเลกุลขนาดเล็กได้ 44,000 โมเลกุล รวมถึงบางชนิดที่อาจเป็นยาปฏิชีวนะที่มีประโยชน์ ( SN: 10/18/14, p. 8 )

นักวิจัยกำลังกลั่นกรองข้อมูลจำนวนมากเพื่อค้นหาและกลั่นกรองนักเก็ตที่คล้ายกันเพื่อพัฒนายาที่ดีขึ้นหรือสร้างความเชื่อมโยงระหว่างตัวแปรทางพันธุกรรมและโรคต่างๆ กระนั้น ขณะที่วิทยาศาสตร์เคลื่อนไปสู่ความพยายามของข้อมูลขนาดใหญ่ ความกังวลก็เพิ่มมากขึ้นว่าสิ่งที่ค้นพบส่วนใหญ่เป็นทองของคนโง่เว็บสล็อต